Κατά τον 18ο και μεγάλο μέρος του 19ου αιώνα, τα Χανιά αποτελούσαν το οικονομικό κέντρο της Κρήτης, λόγω της εξαγωγής προς τις ευρωπαϊκές χώρες μέσω του λιμανιού της πόλης και της Σούδας, των σημαντικών ποσοτήτων λαδιού που παραγόταν κυρίως στην πεδιάδα του Αποκόρωνα. Καλά οχυρωμένη, με μεγάλο λιμάνι και πολυάριθμο μουσουλμανικό πληθυσμό, η πόλη παρέμεινε στα χέρια των μουσουλμάνων κατά τη διάρκεια των διαφόρων εξεγέρσεων και επαναστάσεων. Το 1850 αποφασίστηκε η μεταφορά από το Ηράκλειο στα Χανιά του διοικητικού κέντρου του νησιού, λόγω της μικρής απόστασης από τον κόλπο της Σούδας. Στο πλαίσιο των γεγονότων που ακολούθησαν τη Μεταπολιτευτική Επανάσταση, τα Χανιά βρέθηκαν στο προσκήνιο τον Μάιο του 1896, λόγω των επιθέσεων που εξαπέλυσαν οι μουσουλμάνοι στις χριστιανικές συνοικίες της πόλης. Οι συγκρούσεις και οι σφαγές που ακολούθησαν είχαν σαν επακόλουθο την ανάμειξη των ευρωπαϊκών δυνάμεων και την απόφαση για την αποστολή διεθνούς στρατιωτικής δύναμης στην Κρήτη.
