Ο κόλπος του Μπαλί δεν αποτέλεσε σημείο σταθερής επαναστατικής δράσης, αλλά ένα από τα φυσικά λιμάνια που εξυπηρετούσαν τη θαλάσσια επικοινωνία, κυρίως των επαναστατών, με άλλες περιοχές εντός και εκτός της Κρήτης. Στις πηγές αναφέρεται ως σημείο απόβασης του Νικολάου Ρενιέρη, απεσταλμένου του Καποδίστρια στην Κρήτη το 1829. Αντίστοιχα, στο Μπαλί αποβιβάστηκε τον Σεπτέμβριο του 1866 ο Πάνος Κορωναίος, απ’ όπου στη συνέχεια μετακινήθηκε στο Αρκάδι και αργότερα ο Gustave Florans σε ένα από τα ταξίδια του προς την Κρήτη. Τα επόμενα χρόνια, αποτέλεσε ένα από τα κύρια σημεία προσέγγισης των πλοίων που μετέφεραν προμήθειες και ανθρώπους από και προς την Κρήτη. Η σχετική δραστηριότητα διακόπηκε μόνο μετά την οικοδόμηση σημαντικού αριθμού κουλέδων (πύργων) από τους Οθωμανούς, που τους επέτρεψαν να θέσουν υπό τον διαρκή έλεγχό τους την περιοχή.
