Στα τέλη Ιουνίου του 1823 ο Εμμανουήλ Τομπάζης, ως Αρμοστής της Κρήτης, συγκάλεσε γενική συνέλευση στο ορεινό χωριό της Αρκούδαινας (σήμερα Αρχοντική) του Ρεθύμνου. Παρά τις αντιδράσεις που προκάλεσε η απόφαση των Σφακιανών να προσέλθουν ένοπλοι, το αποτέλεσμα ήταν η θέσπιση της Ενιαυσίου Κρητικής Πολιτείας, εκφράζοντας την κοινή πρόθεση των επαναστατημένων χριστιανών για την καθιέρωση ενός ενιαίου διοικητικού και πολιτικού συστήματος. Τον Αύγουστο του 1828 η Αρκούδαινα αποτέλεσε έναν από τους στόχους των μουσουλμάνων, στο πλαίσιο των επιθέσεων που σκοπό είχαν την εκδίκηση για τον θάνατο του γενιτσάρου Αγριολίδη στην περιοχή της Μεσαράς. Κατά την επανάσταση του 1866, η Αρκούδαινα είχε και πάλι ιδιαίτερο ρόλο λόγω της θέσης επί της διαδρομής που οδηγούσε στον Καλλικράτη και την ευρύτερη περιοχή των Σφακίων. Στις αρχές Νοεμβρίου του 1866 ο Μουσταφά Πασάς κατέλαβε την περιοχή, επιδιώκοντας τη συνθηκολόγηση των Σφακιανών, ενώ αποτέλεσε επίκεντρο πολυάριθμων συγκρούσεων ανάμεσα στους επαναστάτες και τον οθωμανικό στρατό.